1 - Die Epidemiekarten werden aus dem Spielerkartenstapel entfernt.
2 - Der restliche Spielerkartenstapel wird gemischt und an jeden Spieler werden (bei 3 Spielern) 3 Karten ausgeteilt.
3 - Der restliche Stapel wird je nach gewünschtem Schwierigkeitsgrad in 4 bis 6 gleichgroße Stapel aufgeteilt. 4 Stapel werden für das Einsteigerspiel benötigt.
4 - In jeden Stapel wird eine Epidemiekarte gemischt. Die restlichen Epidemiekarten kommen aus dem Spiel.
5 - Aus den 4 Stapeln wird ein einzelner Zugstapel gebildet.